Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERC3Q15034 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HERC3Q15034 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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