Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NCAPHQ15003 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NCAPHQ15003 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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