Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RFTN1Q14699 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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