Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNGB1Q14028 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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