Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAPSQ13938 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms