Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX3Q13761 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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