Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAPSNQ13702 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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