Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HTR4Q13639 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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