Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTCH1Q13635 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTCH1Q13635 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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