Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NAE1Q13564 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NAE1Q13564 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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