Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CBX3Q13185 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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