Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP4Q13115 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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