Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LMAN2Q12907 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms