Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGNL1Q0VF96 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms