Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FAM27E3Q08E93 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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