Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CYP4F3Q08477 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms