Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RUNX1T1Q06455 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms