Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUCB1Q02818 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms