Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CENPEQ02224 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms