Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
OTUD4Q01804 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms