Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
DEFA6Q01524 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms