Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM3AP98173 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM3AP98173 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FAM3AP98173 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM3AP98173 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM3AP98173 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM3AP98173 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM3AP98173 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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FAM3AP98173 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FAM3AP98173 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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