Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSNK2BP67870 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms