Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NCS1P62166 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NCS1P62166 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCS1P62166 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCS1P62166 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCS1P62166 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCS1P62166 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCS1P62166 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCS1P62166 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NCS1P62166 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NCS1P62166 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCS1P62166 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCS1P62166 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCS1P62166 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCS1P62166 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCS1P62166 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCS1P62166 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCS1P62166 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCS1P62166 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCS1P62166 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms