Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
HERVK_113P61574 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms