Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF3P61204 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARF3P61204 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF3P61204 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF3P61204 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF3P61204 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF3P61204 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF3P61204 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF3P61204 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF3P61204 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF3P61204 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARF3P61204 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF3P61204 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF3P61204 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF3P61204 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF3P61204 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF3P61204 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF3P61204 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF3P61204 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF3P61204 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF3P61204 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms