Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
ROMO1P60602 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms