Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MCCD1P59942 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MCCD1P59942 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms