Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EEFSECP57772 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms