Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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HOXD13P35453 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HOXD13P35453 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HOXD13P35453 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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HOXD13P35453 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXD13P35453 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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HOXD13P35453 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXD13P35453 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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