Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNA1P35221 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms