Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGER1P34995 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER1P34995 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER1P34995 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER1P34995 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER1P34995 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER1P34995 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER1P34995 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER1P34995 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER1P34995 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER1P34995 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER1P34995 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER1P34995 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGER1P34995 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms