Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPS1P31327 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPS1P31327 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CPS1P31327 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CPS1P31327 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPS1P31327 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPS1P31327 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPS1P31327 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPS1P31327 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPS1P31327 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPS1P31327 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPS1P31327 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPS1P31327 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms