Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-FP30511 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms