Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARID4AP29374 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms