Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXD10P28358 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD10P28358 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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