Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB4P28070 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms