Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms