Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
POLR2AP24928 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms