Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MMP11P24347 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MMP11P24347 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MMP11P24347 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MMP11P24347 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MMP11P24347 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MMP11P24347 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MMP11P24347 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MMP11P24347 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MMP11P24347 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MMP11P24347 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms