Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRKACBP22694 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRKACBP22694 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRKACBP22694 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKACBP22694 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms