Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB5AP20339 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms