Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD53P19397 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD53P19397 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD53P19397 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms