Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTLA4P16410 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTLA4P16410 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTLA4P16410 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms