Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD46P15529 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD46P15529 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD46P15529 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD46P15529 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD46P15529 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD46P15529 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD46P15529 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD46P15529 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD46P15529 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms