Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRA1P14867 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms