Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HLA-DOBP13765 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms