Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDH1P12830 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDH1P12830 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDH1P12830 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms