Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PGA3P0DJD8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms