Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF3P09919 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSF3P09919 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms